נייעס

אין די לעצטע צען יאר, איז גענע סיקווענסינג טעכנאָלאָגיע ברייט גענוצט געוואָרן אין ראַק פאָרשונג און קלינישער פּראַקטיק, און איז געוואָרן אַ וויכטיק געצייַג צו אַנטדעקן די מאָלעקולאַרע קעראַקטעריסטיקס פון ראַק. פֿאָרשריטן אין מאָלעקולאַרער דיאַגנאָז און טאַרגעטעד טעראַפּיע האָבן פּראָמאָטירט די אַנטוויקלונג פון טומאָר פּרעציזיע טעראַפּיע קאָנצעפּטן און געבראַכט גרויסע ענדערונגען אין דעם גאַנצן פעלד פון טומאָר דיאַגנאָז און באַהאַנדלונג. גענעטישע טעסטינג קען גענוצט ווערן צו וואָרענען ראַק ריזיקע, פירן באַהאַנדלונג דיסיזשאַנז און אָפּשאַצן פּראָגנאָז, און איז אַ וויכטיק געצייַג צו פֿאַרבעסערן פּאַציענט קלינישע רעזולטאַטן. דאָ, מיר סאַמערייזן די לעצטע אַרטיקלען ארויס אין CA Cancer J Clin, JCO, Ann Oncol און אנדערע זשורנאַלן צו איבערקוקן די אַפּלאַקיישאַן פון גענעטישע טעסטינג אין ראַק דיאַגנאָז און באַהאַנדלונג.

סאָמאַטישע מוטאַציעס און דזשערמליין מוטאַציעס. בכלל, ראַק ווערט געפֿירט דורך דנ״א מוטאַציעס וואָס קענען געירשנט ווערן פֿון עלטערן (דזשערמליין מוטאַציעס) אָדער באַקומען מיט עלטער (סאָמאַטישע מוטאַציעס). דזשערמליין מוטאַציעס זענען פֿאַראַן פֿון געבורט, און דער מוטאַטאָר טראָגט געוויינטלעך די מוטאַציע אין דער דנ״א פֿון יעדער צעל אין קערפּער און קען איבערגעגעבן ווערן צו קינדער. סאָמאַטישע מוטאַציעס ווערן באַקומען דורך יחידים אין נישט-גאַמעטישע צעלן און ווערן געוויינטלעך נישט איבערגעגעבן צו קינדער. ביידע דזשערמליין און סאָמאַטישע מוטאַציעס קענען צעשטערן די נאָרמאַלע פֿונקציאָנעלע אַקטיוויטעט פֿון צעלן און פֿירן צו אַ בייזאַרטיקער טראַנספֿאָרמאַציע פֿון צעלן. סאָמאַטישע מוטאַציעס זענען אַ שליסל טרייבער פֿון בייזאַרטיקייט און דער מערסט פּרעדיקטיוו ביאָמאַרקער אין אָנקאָלאָגיע; אָבער, אַרום 10 ביז 20 פּראָצענט פֿון טומאָר פּאַציענטן טראָגן דזשערמליין מוטאַציעס וואָס באַדייטנד פֿאַרגרעסערן זייער ראַק ריזיקע, און עטלעכע פֿון די מוטאַציעס זענען אויך טעראַפּעווטיש.
דרייווער מוטאציע און פאסאזשיר מוטאציע. נישט אלע דנ״א וואריאנטן ווירקן אויף צעל פונקציע; דורכשניטלעך, נעמט עס פינף ביז צען גענאמישע געשעענישן, באקאנט אלס "דרייווער מוטאציעס," צו אויסלעזן נארמאלע צעל דעגענעראציע. דרייווער מוטאציעס פאסירן אפט אין גענעס וואס זענען ענג פארבונדן מיט צעל לעבן אקטיוויטעטן, ווי גענעס וואס זענען פארמישט אין צעל וואוקס רעגולאציע, דנ״א פארריכטונג, צעל ציקל קאנטראל און אנדערע לעבן פראצעסן, און האבן דעם פאטענציאל צו ווערן גענוצט אלס טעראפויטישע צילן. אבער, די גאנצע צאל מוטאציעס אין יעדן קענסער איז גאנץ גרויס, פון א פאר טויזנט אין געוויסע ברוסט קענסערס ביז מער ווי 100,000 אין געוויסע שטארק וועריאבל קאלעקטראלע און ענדאָמעטריאל קענסערס. רוב מוטאציעס האבן נישט קיין אדער באגרענעצטע ביאלאגישע באדייטונג, אפילו אויב די מוטאציע פאסירט אין דער קאדירונג ראיאן, ווערן אזעלכע נישט-באדייטנדע מוטאציאנאלע געשעענישן גערופן "פאסאזשיר מוטאציעס". אויב א גענע וואריאנט אין א באשטימטן טומאר טיפ פאראויסזאגט זיין רעאקציע צו אדער קעגנשטעל צו באהאנדלונג, ווערט די וואריאנט באטראכט אלס קליניש אפערירבאר.
אָנקאָגענעס און טומאָר סאַפּרעסער גענעס. גענעס וואָס זענען אָפט מוטירט אין ראַק קענען גראָב צעטיילט ווערן אין צוויי קאַטעגאָריעס, אָנקאָגענעס און טומאָר סאַפּרעסער גענעס. אין נאָרמאַלע צעלן, שפּילט דער פּראָטעין קאָדירט דורך אָנקאָגענעס דער הויפּט די ראָלע פון ​​פּראָמאָטירן צעל פּראָליפעראַציע און ינכיבאַטינג צעל אַפּאָפּטאָסיס, בשעת דער פּראָטעין קאָדירט דורך אָנקאָסאַפּרעסער גענעס איז דער הויפּט פאַראַנטוואָרטלעך פֿאַר נעגאַטיוו רעגולירן צעל טיילונג צו האַלטן נאָרמאַל צעל פונקציע. אין דעם מאַליגנאַנט טראַנספאָרמאַציע פּראָצעס, פירט גענאָמישע מוטאַציע צו דער פֿאַרשטאַרקונג פון אָנקאָגענע טעטיקייט און דער פאַרקלענערונג אָדער אָנווער פון אָנקאָסאַפּרעסער גענע טעטיקייט.
קליינע וועריאציע און סטרוקטורעלע וועריאציע. דאס זענען די צוויי הויפט טיפן מוטאציעס אין דעם גענאם. קליינע וואריאנטן ענדערן די דנ״א דורך ענדערן, אויסמעקן, אדער צולייגן א קליינע צאל באזעס, אריינגערעכנט באזע אינסערציע, אויסמעקן, פרעיםשיפט, אנהייב קאדאן פארלוסט, אפשטעלן קאדאן פארלוסט מוטאציעס, א.א.וו. סטרוקטורעלע וועריאציע איז א גרויסע גענאם רעאררענדזשמענט, וואס נעמט אריין גענע סעגמענטן וואס ריינדזשען אין גרייס פון א פאר טויזנט באזעס ביזן מערהייט פון די כראמאזאם, אריינגערעכנט גענע קאפיע צאל ענדערונגען, כראמאזאם אויסמעקן, דופליקאציע, אינווערסיע אדער טראנסלאקאציע. די מוטאציעס קענען פאראורזאכן א רעדוקציע אדער פארבעסערונג פון פראטעין פונקציע. אין צוגאב צו ענדערונגען אויפן לעוועל פון יחידישע גענעס, זענען גענאמישע סיגנאטורן אויך טייל פון קלינישע סיקווענסינג באריכטן. גענאמישע סיגנאטורן קענען געזען ווערן ווי קאמפלעקסע מוסטערן פון קליינע און/אדער סטרוקטורעלע וועריאציעס, אריינגערעכנט טומאר מוטאציע לאוד (TMB), מיקראסאטעליט אינסטאביליטעט (MSI), און האמאלאגישע רעקאמבינאציע חסרונות.

קלאָנאַלע מוטאַציע און סובקלאָנאַלע מוטאַציע. קלאָנאַלע מוטאַציעס זענען פאַראַן אין אַלע טומאָר צעלן, זענען פאַראַן ביי דיאַגנאָז, און בלייבן פאַראַן נאָך באַהאַנדלונג פּראָגרעס. דעריבער, קלאָנאַלע מוטאַציעס האָבן די פּאָטענציעל צו ווערן גענוצט ווי טומאָר טעראַפּעווטישע צילן. סובקלאָנאַלע מוטאַציעס זענען פאַראַן אין בלויז אַ סאַבסעט פון ראַק צעלן און קען זיין דיטעקטעד אין די אָנהייב פון דיאַגנאָז, אָבער פאַרשווינדן מיט סאַבסאַקוואַנט ריקעראַנס אָדער דערשייַנען בלויז נאָך באַהאַנדלונג. ראַק העטעראָגעניטי רעפערס צו די בייַזייַן פון קייפל סובקלאָנאַלע מוטאַציעס אין אַ איין ראַק. באַמערקענסווערט, די גרויס מערהייט פון קליניש באַטייַטיק דרייווער מוטאַציעס אין אַלע פּראָסט ראַק מינים זענען קלאָנאַלע מוטאַציעס און בלייבן סטאַביל איבער ראַק פּראָגרעס. קעגנשטעל, וואָס איז אָפט מעדיאַטעד דורך סובקלאָנעס, קען נישט זיין דיטעקטעד אין די צייט פון דיאַגנאָז אָבער דערשיינט ווען עס רילאַפּסיז נאָך באַהאַנדלונג.

די טראדיציאנעלע טעכניק FISH אדער צעל קאריאטיפ ווערט גענוצט צו דעטעקטירן ענדערונגען אויפן כראמאזאמען לעוועל. FISH קען גענוצט ווערן צו דעטעקטירן גענע פיוזשאנס, דילעשאנס, און אמפליפיקאציעס, און ווערט באטראכט אלס דער "גאלדענער סטאנדארט" פארן דעטעקטירן אזעלכע וואריאנטן, מיט הויכער גענויקייט און סענסיטיוויטי אבער באגרענעצטער דורכפלוס. אין געוויסע העמאטאלאגישע מאליגנאנסיעס, ספעציעל אקוטע לויקעמיע, ווערט קאריאטיפינג נאך אלץ גענוצט צו פירן דיאגנאז און פראגנאז, אבער די טעכניק ווערט ביסלעכווייז ערזעצט דורך צילגעריכטעטע מאלעקולארע פראבעס ווי FISH, WGS, און NGS.
ענדערונגען אין יחידישע גענעס קענען דעטעקטירט ווערן דורך PCR, סיי אין רעאל-צייט PCR און סיי אין דידזשיטאל דראפ PCR. די טעכניקן האבן הויכע סענסיטיוויטי, זענען באזונדערס פאסיג פארן דעטעקטירן און מאניטארירן קליינע רעשט-לעזיעס, און קענען באקומען רעזולטאטן אין א רעלאטיוו קורצער צייט, דער חסרון איז אז דער דעטעקשאַן-ראַנג איז באגרענעצט (געווענליך דעטעקטירן זיי נאר מוטאציעס אין איין אדער א פאר גענעס), און די מעגלעכקייט צו דורכפירן קייפל טעסטן איז באגרענעצט.
אימונאָכיסטאָכעמיע (IHC) איז אַ פּראָטעין-באַזירט מאָניטאָרינג געצייַג וואָס ווערט אָפט געניצט צו דעטעקטירן די אויסדרוק פון ביאָמאַרקערס ווי ERBB2 (HER2) און עסטראָגען רעסעפּטאָרן. IHC קען אויך געניצט ווערן צו דעטעקטירן ספּעציפֿישע מוטירטע פּראָטעאינען (ווי BRAF V600E) און ספּעציפֿישע גען פוסיאָנס (ווי ALK פוסיאָנס). דער מייַלע פון ​​IHC איז אַז עס קען לייכט אינטעגרירט ווערן אין דעם רוטין געוועב אַנאַליז פּראָצעס, אַזוי עס קען קאָמבינירט ווערן מיט אַנדערע טעסץ. אין דערצו, IHC קען צושטעלן אינפֿאָרמאַציע וועגן סובסעלולאַרע פּראָטעין לאָקאַליזאַציע. די חסרונות זענען לימיטירטע סקאַלאַביליטי און הויכע אָרגאַניזאַציאָנעלע פאָדערונגען.
צווייטע-גענעראציע סיקווענסינג (NGS) NGS ניצט הויך-דורכפיר פּאַראַלעל סיקווענסינג טעקניקס צו דעטעקטירן וועריאַציעס אויף די DNA און/אָדער RNA מדרגה. די טעכניק קען ווערן גענוצט צו סיקווענסן ביידע די גאנצע גענאָם (WGS) און די דזשין געגנטן פון אינטערעס. WGS גיט די מערסט פולשטענדיק גענאָמישע מוטאַציע אינפֿאָרמאַציע, אָבער עס זענען פילע שטערונגען צו זיין קליניש אַפּלאַקיישאַן, אַרייַנגערעכנט די נויט פֿאַר פריש טומאָר געוועב סאַמפּאַלז (WGS איז נאָך נישט פּאַסיק פֿאַר אַנאַלייזינג פאָרמאַלין-ימאָובאַלייזד סאַמפּאַלז) און די הויך קאָסטן.
טאַרגעטעד NGS סיקוואַנסינג כולל גאַנצע עקסאָן סיקוואַנסינג און ציל גען פּאַנעל. די טעסץ באַרייַכערן געביטן פון אינטערעס דורך DNA פּראָובז אָדער PCR אַמפּליפיקאַטיאָן, דערמיט לימיטינג די סומע פון ​​סיקוואַנסינג פארלאנגט (די גאנצע עקסאָם מאכט אויס 1 צו 2 פּראָצענט פון די גענאָם, און אפילו גרויס פּאַנאַלז מיט 500 גענעס מאַכן אויס בלויז 0.1 פּראָצענט פון די גענאָם). כאָטש גאַנצע עקסאָן סיקוואַנסינג פּערפאָרמז גוט אין פאָרמאַלין-פיקסט געוועבן, זייַן קאָסטן בלייבט הויך. ציל גען קאָמבינאַציעס זענען לעפיערעך עקאָנאָמיש און לאָזן בייגיקייט אין סעלעקטינג גענעס צו זיין טעסטעד. אין אַדישאַן, סערקיאַלייטינג פריי DNA (cfDNA) איז ימערדזשינג ווי אַ נייַע אָפּציע פֿאַר גענאָמיק אַנאַליסיס פון ראַק פּאַטיענץ, באַוווסט ווי פליסיק ביאָפּסיעס. ביידע ראַק סעלז און נאָרמאַל סעלז קענען מעלדונג DNA אין די בלאַדסטרים, און די DNA אָפּגעוואָרפן פון ראַק סעלז איז גערופן סערקיאַלייטינג טומאָר DNA (ctDNA), וואָס קענען זיין אַנאַלייזד צו דעטעקט פּאָטענציעל מוטאַטיאָנס אין טומאָר סעלז.
די אויסוואל פון טעסט ווענדט זיך אין דעם ספעציפישן קלינישן פראבלעם וואס דארף ווערן באהאנדלט. רוב פון די ביאָמאַרקערס פארבונדן מיט באשטעטיגטע טעראַפּיעס קענען ווערן דעטעקטירט דורך FISH, IHC, און PCR טעכניקן. די מעטאָדן זענען גלייַכגעוויכטיק פֿאַר דער דעטעקציע פון ​​קליינע מאָסן ביאָמאַרקערס, אָבער זיי פֿאַרבעסערן נישט די עפֿעקטיווקייט פון דעטעקציע מיט פֿאַרגרעסערנדיקן דורכפֿלוס, און אויב מען דעטעקטירט צו פֿיל ביאָמאַרקערס, קען עס נישט זיין גענוג געוועב פֿאַר דעטעקציע. אין עטלעכע ספּעציפֿישע קענסערס, ווי לונג ראַק, וואו געוועב מוסטערן זענען שווער צו באַקומען און עס זענען פֿאַראַן קייפל ביאָמאַרקערס צו טעסטן, איז די נוצן פון NGS אַ בעסערע ברירה. אין מסקנא, די אויסוואל פון אַסיי ווענדט זיך אין דער צאָל ביאָמאַרקערס וואָס מען דאַרף טעסטן פֿאַר יעדן פּאַציענט און די צאָל פּאַציענטן וואָס מען דאַרף טעסטן פֿאַר דעם ביאָמאַרקער. אין עטלעכע פֿאַלן איז די נוצן פון IHC/FISH גענוג, ספּעציעל ווען די ציל איז שוין אידענטיפֿיצירט געוואָרן, ווי די דעטעקציע פון ​​עסטראָגען רעסעפּטאָרן, פּראָגעסטעראָן רעסעפּטאָרן און ERBB2 אין ברוסט ראַק פּאַציענטן. אויב עס איז נויטיק אַ מער קאָמפּרעהענסיווע אויספֿאָרשונג פון גענאָמישע מוטאַציעס און די זוכן פֿאַר פּאָטענציעלע טעראַפּעווטישע צילן, איז NGS מער אָרגאַניזירט און קאָסטן-עפֿעקטיוו. דערצו, קען מען באטראכטן NGS אין פעלער וואו IHC/FISH רעזולטאטן זענען צוויידייטיג אדער נישט קלאר.

פארשידענע גיידליינז געבן אנווייזונגען וועגן וועלכע פאציענטן זאלן זיין בארעכטיגט פאר גענעטישע טעסטן. אין 2020, האט די ESMO פּרעסיסיאָן מעדיצין ארבעטס גרופע ארויסגעגעבן די ערשטע NGS טעסטן רעקאמענדאציעס פאר פאציענטן מיט פארגעשריטענעם קענסער, רעקאמענדירנדיג רוטינע NGS טעסטן פאר פארגעשריטענע נישט-סקוואמאַסע נישט-קליינע צעל לונג קענסער, פּראָסטאַט קענסער, קאָלאָרעקטאַל קענסער, גאַל דאַקט קענסער, און אָווועריאַן קענסער טומאָר סאַמפּאַלז, און אין 2024, האט ESMO דערהייַנטיקט אויף דעם באַזיס, רעקאמענדירנדיג די ארייננעמונג פון ברוסט קענסער און זעלטענע טומאָרן. אַזאַ ווי גאַסטראָוינטעסטאַנאַל סטראָמאַל טומאָרן, סאַרקאָמאַס, טיירויד קענסערס און קענסערס פון אומבאַקאַנט אָפּשטאַם.
אין 2022, ASCO'ס קלינישע מיינונג אויף סאָמאַטישע גענאָם טעסטינג אין פּאַציענטן מיט מעטאַסטאַטישע אָדער אַוואַנסירטע ראַק זאגט אַז אויב אַ ביאָמאַרקער-פֿאַרבונדענע טעראַפּיע איז באוויליקט אין פּאַציענטן מיט מעטאַסטאַטישע אָדער אַוואַנסירטע סאָליד טומאָרס, גענעטישע טעסטינג איז רעקאַמענדיד פֿאַר די פּאַציענטן. למשל, גענאָמיש טעסטינג זאָל זיין דורכגעפירט אין פּאַציענטן מיט מעטאַסטאַטישע מעלאַנאָמאַ צו סקרינען פֿאַר BRAF V600E מוטאַציעס, ווייַל RAF און MEK ינכיבאַטאָרס זענען באוויליקט פֿאַר דעם אינדיקאַציע. אין דערצו, גענעטישע טעסטינג זאָל אויך זיין דורכגעפירט אויב עס איז אַ קלאָר מאַרקער פון קעגנשטעל פֿאַר די מעדיצין צו זיין אַדמיניסטרירט צו דעם פּאַציענט. Egfrmab, למשל, איז נישט עפעקטיוו אין KRAS מוטאַנט קאָלאָרעקטאַל ראַק. ווען מען באַטראַכט אַ פּאַציענט'ס פּאַסיק פֿאַר דזשין סיקוואַנסינג, זאָל דער פּאַציענט'ס גשמיות סטאַטוס, קאָמאָרבידיטיז און טומאָר בינע זיין ינטאַגרייטיד, ווייַל די סעריע פון ​​​​​​טריץ פארלאנגט פֿאַר גענאָם סיקוואַנסינג, אַרייַנגערעכנט פּאַציענט צושטימונג, לאַבאָראַטאָריע פּראַסעסינג און אַנאַליסיס פון סיקוואַנסינג רעזולטאַטן, דאַרפן דעם פּאַציענט צו האָבן אַדאַקוואַט גשמיות קאַפּאַציטעט און לעבן יקספּעקטאַנסי.
אין צוגאב צו סאמאטישע מוטאציעס, זאלן געוויסע קענסערס אויך געטעסט ווערן פאר גערם ליניע גענעס. טעסטן פאר גערם ליניע מוטאציעס קען איינפלוסן באהאנדלונג באשלוסן פאר קענסערס ווי BRCA1 און BRCA2 מוטאציעס אין ברוסט, אוואריאנען, פראסטאט, און פאנקרעאטישע קענסערס. גערם ליניע מוטאציעס קענען אויך האבן אימפליקאציעס פאר צוקונפטיגע קענסער סקרינינג און פארמיידונג אין פאציענטן. פאציענטן וואס זענען פאטענציעל פאסיג פאר טעסטן פאר גערם ליניע מוטאציעס דארפן טרעפן געוויסע באדינגונגען, וואס שליסן איין פאקטארן ווי פאמיליע געשיכטע פון ​​קענסער, עלטער ביי דיאגנאז, און טיפ קענסער. אבער, אסאך פאציענטן (ביז 50%) וואס טראגן פאטאגענע מוטאציעס אין די גערם ליניע טרעפן נישט די טראדיציאנעלע קריטעריעס פאר טעסטן פאר גערם ליניע מוטאציעס באזירט אויף פאמיליע געשיכטע. דעריבער, צו מאקסימיזירן די אידענטיפיקאציע פון ​​מוטאציע טרעגער, רעקאמענדירט די נאציאנאלע קאמפרעהענסיוו קענסער נעטווארק (NCCN) אז אלע אדער רוב פאציענטן מיט ברוסט, אוואריאנען, ענדאָמעטריאל, פאנקרעאטיש, קאלעקטראלעקטאל, אדער פראסטאט קענסער זאלן געטעסט ווערן פאר גערם ליניע מוטאציעס.
בנוגע דעם צייטפּונקט פון גענעטישע טעסטינג, ווייל די גרויסע מערהייט פון קליניש באַדייטנדיקע דרייווער מוטאַציעס זענען קלאָנאַל און רעלאַטיוו סטאַביל איבער דעם גאַנג פון ראַק פּראָגרעס, איז עס גלייַך צו דורכפירן גענעטישע טעסטינג אויף פּאַציענטן אין דער צייט פון דיאַגנאָז פון אַוואַנסירטע ראַק. פֿאַר שפּעטערדיקע גענעטישע טעסטינג, ספּעציעל נאָך מאָלעקולאַר טאַרגעטעד טעראַפּיע, איז ctDNA טעסטינג מער אַדוואַנטיידזשאַס ווי טומאָר געוועב DNA, ווייל בלוט DNA קען אַנטהאַלטן DNA פון אַלע טומאָר לעזשאַנז, וואָס איז מער גינסטיק צו באַקומען אינפֿאָרמאַציע וועגן טומאָר העטעראָגעניטי.
אנאליז פון ctDNA נאך באהאנדלונג קען מעגליך פאראויסזאגן טומאר רעאקציע צו באהאנדלונג און אידענטיפיצירן קראנקהייט פראגרעסיע פריער ווי סטאנדארט בילדגעבונג מעטאדן. אבער, פראטאקאלן פארן ניצן די דאטן צו פירן באהאנדלונג באשלוסן זענען נישט געגרינדעט געווארן, און ctDNA אנאליז איז נישט רעקאמענדירט אחוץ אין קלינישע שטודיעס. ctDNA קען אויך געניצט ווערן צו אפשאצן קליינע רעזידועל לעזיעס נאך ​​ראדיקאלער טומאר כירורגיע. ctDNA טעסטן נאך כירורגיע איז א שטארקער פאראויסזאגער פון שפעטערדיגע קראנקהייט פראגרעסיע און קען העלפן באשטימען צי א פאציענט וועט נוץ האבן פון אדזשווואנט כעמאטעראפיע, אבער עס איז נאך אלץ נישט רעקאמענדירט צו ניצן ctDNA אינדרויסן פון קלינישע שטודיעס צו פירן אדזשווואנט כעמאטעראפיע באשלוסן.

דאַטן פּראַסעסינג דער ערשטער שריט אין גענאָם סיקווענסינג איז צו עקסטראַקטן דנאַ פון פּאַציענט סאַמפּאַלז, צוגרייטן ביבליאָטעקן, און דזשענערירן רויע סיקווענסינג דאַטן. די רויע דאַטן דאַרפן ווייטערדיקע פּראַסעסינג, אַרייַנגערעכנט פילטערינג נידעריק-קוואַליטעט דאַטן, פאַרגלייַכן עס מיט די רעפערענץ גענאָם, ידענטיפיצירן פאַרשידענע טייפּס פון מוטאַציעס דורך פאַרשידענע אַנאַליטישע אַלגערידאַמז, באַשטימען די ווירקונג פון די מוטאַציעס אויף פּראָטעין איבערזעצונג, און פילטערינג גערם ליניע מוטאַציעס.
דרייווער דזשין אנאטאציע איז דיזיינט צו אונטערשיידן דרייווער און פאסאזשיר מוטאציעס. דרייווער מוטאציעס פירן צו פארלוסט אדער פארבעסערונג פון טומאר סאַפּרעסער דזשין טעטיקייט. קליינע וועריאנטן וואס פירן צו די אינאקטיוואציע פון ​​טומאר סאַפּרעסער דזשינען שליסן איין נאַנסענס מוטאציעס, פרעיםשיפט מוטאציעס, און שליסל ספּלייסינג סייט מוטאציעס, ווי אויך ווייניקער אָפט אָנהייב קאָדאָן דילישאַן, האַלטן קאָדאָן דילישאַן, און אַ ברייט קייט פון ינטראָן ינסערשאַן/דילישאַן מוטאציעס. אין דערצו, מיססענס מוטאציעס און קליינע ינטראָן ינסערשאַן/דילישאַן מוטאציעס קענען אויך פירן צו פארלוסט פון טומאר סאַפּרעסער דזשין טעטיקייט ווען זיי ווירקן אויף וויכטיקע פונקציאָנעלע דאָומיינען. סטרוקטורעלע וועריאנטן וואס פירן צו פארלוסט פון טומאר סאַפּרעסער דזשין טעטיקייט שליסן איין טיילווייזע אדער פולשטענדיקע דזשין דילישאַן און אנדערע גענאָמישע וועריאנטן וואס פירן צו צעשטערונג פון די דזשין לייענען ראַם. קליינע וועריאנטן וואס פירן צו פארבעסערטע פונקציע פון ​​אָנקאָגענעס שליסן איין מיססענס מוטאציעס און געלעגנטלעכע ינטראָן ינסערשאַנז/דילישאַנז וואס צילן וויכטיקע פּראָטעין פונקציאָנעלע דאָומיינען. אין זעלטענע פאלן, פּראָטעין טראַנגקיישאַן אָדער ספּלייסינג סייט מוטאציעס קענען פירן צו די אַקטיוואַציע פון ​​אָנקאָגענעס. סטרוקטורעלע וועריאציעס וואס פירן צו אָנקאָגענע אַקטיוואַציע שליסן איין דזשין פיוזשאַן, דזשין דילישאַן, און דזשין דופּליקאַציע.
קלינישע אינטערפּרעטאַציע פון ​​גענאָמישע וואַריאַציע אַססעססירט די קלינישע באַדייַטונג פון אידענטיפיצירטע מוטאַציעס, ד"ה זייער פּאָטענציעל דיאַגנאָסטיש, פּראָגנאָסטיש אָדער טעראַפּעווטיש ווערט. עס זענען עטלעכע עווידענס-באַזירטע גראַדירונג סיסטעמען וואָס קענען ווערן גענוצט צו פירן די קלינישע אינטערפּרעטאַציע פון ​​גענאָמישע וואַריאַציע.
די מעמאָריאַל סלאָאַן-קעטערינג קענסער צענטער'ס פּרעסיסיאָן מעדיצין אָנקאָלאָגי דאַטאַבייס (אָנקאָקב) קלאַסיפיצירט גען וואַריאַנטן אין פיר לעוועלס באַזירט אויף זייער פּרעדיקטיוו ווערט פֿאַר מעדיצין נוצן: לעוועל 1/2, FDA-באַשטעטיקט, אָדער קליניש-סטאַנדאַרט ביאָמאַרקערס וואָס פאָרויסזאָגן די ענטפער פון אַ ספּעציפיש אינדיקאַציע צו אַ באַשטעטיקט מעדיצין; לעוועל 3, FDA-באַשטעטיקט אָדער נישט-באַשטעטיקט ביאָמאַרקערס וואָס פאָרויסזאָגן ענטפער צו נייַע טאַרגעטעד דרוגס וואָס האָבן געוויזן צוזאָג אין קלינישע טריאַלס, און לעוועל 4, נישט-FDA-באַשטעטיקט ביאָמאַרקערס וואָס פאָרויסזאָגן ענטפער צו נייַע טאַרגעטעד דרוגס וואָס האָבן געוויזן איבערצייגנדיק ביאָלאָגיש באַווייַזן אין קלינישע טריאַלס. א פינפטע סובגרופּע פֿאַרבונדן מיט באַהאַנדלונג קעגנשטעל איז צוגעגעבן געוואָרן.
די אמעריקאנער געזעלשאפט פאר מאלעקולארער פּאַטאָלאָגיע (AMP)/אמעריקאנער געזעלשאפט פון קלינישער אָנקאָלאָגיע (ASCO)/קאָלעדזש פון אמעריקאנער פּאַטאַלאָגיסטן (CAP) גיידליינז פאר דער אינטערפּרעטאַציע פון ​​סאָמאַטישער וואַריאַציע טיילן סאָמאַטישער וואַריאַציע אין פיר קאַטעגאָריעס: גראַד I, מיט שטאַרקער קלינישער באַדייַטונג; גראַד II, מיט פּאָטענציעלער קלינישער באַדייַטונג; גראַד III, קלינישער באַדייַטונג אומבאַקאַנט; גראַד IV, נישט באַקאַנט צו זיין קליניש באַדייַטנדיק. נאָר גראַד I און II וואַריאַנטן זענען ווערטפול פֿאַר באַהאַנדלונג דיסיזשאַנז.
ESMO'ס מאָלעקולאַרער ציל קליניש אָפּעראַביליטי סקאַלע (ESCAT) קלאַסיפיצירט גען וואַריאַנטן אין זעקס לעוועלס: לעוועל I, צילן פּאַסיק פֿאַר רוטין נוצן; פאַזע II, אַ ציל וואָס ווערט נאָך שטודירט, וועט מסתּמא ווערן גענוצט צו סקרינען די פּאַציענט פּאָפּולאַציע וואָס קען נוץ האָבן פון דער ציל מעדיצין, אָבער מער דאַטן זענען דארף צו שטיצן עס. גראַד III, טאַרגעטעד גען וואַריאַנטן וואָס האָבן דעמאָנסטרירט קליניש נוץ אין אנדערע ראַק מינים; גראַד IV, בלויז טאַרגעטעד גען וואַריאַנטן געשטיצט דורך פּרעקליניש זאָגן; אין גראַד V, איז דאָ זאָגן צו שטיצן די קלינישע באַדייַט פון טאַרגעטינג די מוטאַציע, אָבער איין-מעדיצין טעראַפּיע קעגן דער ציל פאַרלענגערט נישט ניצל, אָדער אַ קאָמבינאַציע באַהאַנדלונג סטראַטעגיע קען ווערן אנגענומען; גראַד X, מאַנגל פון קליניש ווערט.